Игрок заканчивает игру сбив вертолет, тем самым, мы ставим точку в истории с террористами и диверсантами, которые совместными усилиями пытались завладеть информацией о секретных разработках в подземных лабораториях «КРОТ». В финальном ролике мы видим, что мутанты все-таки выбрались на верхние уровни, и атакуют ученых лаборатории «КРОТ-3». Что же случилось с Полиной? Какая судьба ждет подземный комплекс? Удастся ли избавиться от нависшей угрозы? На эти и многие другие вопросы даст ответ продолжение, которое позволит игроку вернуться на нижние уровни, чтобы устранить опасность, исходящую от заброшенной лаборатории.